人体微生物组计划（Human Microbiome Project，HMP）是 2003 年完成的人类基因组计划的延伸，也是第一个真正意义上的微生物组计划。在 2007 年底宣布发起时，HMP 的目标之一是为至少 900 种在人体中驻扎的细菌成功绘制出参照基因组序列。HMP 一期的工作中一共产出了 14.23Tb 数据，得到了 3000 株微生物的基因组信息。
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